En el escritorio del procurador Alejandro Ordóñez hay denuncias y anónimos que hablan de presuntas relaciones del ministro Germán Vargas Lleras con los paramilitares del Caquetá. También hay recortes de prensa que relatan historias sobre el tema. Con esta documentación, Ordóñez abrió la indagación preliminar contra el Alto Funcionario. El Procurador le pidió a la Corte Suprema que informe si en algún momento investigó a Vargas Lleras por conductas relacionadas por paramilitarismo. También le pidió a la Unidad de Justicia y Paz de la Fiscalía que le remita cualquier referencia que haya realizado un jefe paramilitar donde se hable del Ministro. La investigación del Ministerio Público tiene que ver con la época en que Vargas sirvió como senador.
