En una entrevista para la más reciente portada de la revista Vanity Fair (España) la actriz afirmó: “Tener un hijo es como tener un bolso. Puedes ir a cualquier sitio con él, en cualquier momento, es tranquilo y sencillo. Dos es dulce. ¡Tres, un circo!”.
Stone tiene tres hijos. Su primer hijo, Roan, lo tuvo con Phil Bronstein, quien obtuvo la custodia del niño. En 2006 la actriz adoptó a Laird y Quin, ya como madre soltera.
